Центърът е създаден през 1955 година, за да обслужва населението на три области – Пловдив, Пазарджик и Смолян.

Днес Комплексен Онкологичен Център – Пловдив обслужва пациенти както от тези три области, така и все повече от цялата страна. Комплексен Онкологичен Център – Пловдив е вторият по големина Онкологичен център в страната.

В Комплексен Онкологичен Център – Пловдив е изграден и се поддържа най-големият в страната Регионален Раков Регистър, който е част от Националния Раков Регистър. Регистрираните за диспансерно наблюдение и активно лечение до края на 2014 година са почти 40 000 пациента, като всеки ден се регистрират нови 30-40 случая.

Така посочените медицински дейности се осъществяват на 260 разкрити болнични легла по следните медицински специалности:

• Медицинска онкология
• Гастроентерология
• Клинична хематология
• Пневмология и фтизиатрия
• Хирургия
• Анестезиология и интензивно лечение
• Акушерство и гинекология
• Радиология
• Кожни и венерически болести
• Клинична лаборатория
• Обща и клинична патология
• Образна диагностика
• Урология
• УНГ болести
• Лъчелечение